La différence entre la synthèse de l'ADN et de l'ARN

La synthèse de l'ADN et de l'ARN est basée sur la stratégie de synthèse en phase solide et la chimie des phosphoramidites, un synthétiseur d'ADN pourrait être utilisé pour synthétiser de l'ARN ou des analogues d'ARN sans autre modification, et les réactifs de la synthèse de l'ADN pourraient être utilisés directement dans l'ARN et les acides nucléiques artificiels. ' la synthèse.Comme le montre la figure 1, le 2'-hydroxy dans le phosphoramidite d'ARN est protégé par un groupe protecteur silyle, c'est-à-dire le t-butyldiméthylsilyle (TBDMS), empêchant les réactions secondaires sur le groupe 2'-hydroxy fragile.Le groupe TBDMS volumineux a gêné la réaction entre le phosphoramidite et le groupe 5'-hydroxy sur le support solide, et un temps de couplage plus long est nécessaire pour obtenir une efficacité de couplage satisfaisante.

Semblable à la synthèse de l'ADN, l'ARN synthétisé a d'abord été clivé du support solide par aminolyse, puis le groupe TBDMS a été clivé par le fluorure de tétrabutylammonium (TBAF) ou le trihydrofluorure de triméthylamine.L'ARN brut pourrait être purifié par recristallisation dans l'alcool et HPLC.

Synthèse d'ADN et d'ARN1

Figure 1. La structure chimique des éléments de base de la synthèse de l’ADN et de l’ARN.

a) phosphoramidite dABz et b) phosphoramidite rABz 2'-OTBDMS.
Le développement du médicament siARN nécessite que les analogues de structure de l'ARN natif augmentent la biocompatibilité, le 2'-hydroxy sur l'ARN pourrait être remplacé par les groupes MeO, F et MOE, et l'acide nucléique verrouillé (LNA) donne également de bonnes performances en thérapie par ARN. (Figure 2).Ces phosphoramidites donnent des actifs similaires à ceux des phosphoramidites de type ADN dans la synthèse, et le processus de traitement et de purification de ces acides nucléiques non naturels est similaire à celui de l'ADN natif.

Synthèse d'ADN et d'ARN2

Figure 2. La structure chimique des éléments constitutifs des médicaments siARN.a) phosphoramidite dABz 2-MeO ;b) phosphoramidite dABz 2-F;c) phosphoramidite dABz 2-MOE et d) phosphoramidite verrouillé dABz.

Phosphoramiditessont essentiels à la synthèse des gènes, comprenant principalement les familles ADN et ARN et leurs dérivés, tous les phosphoramidites ci-dessus que nous pouvons proposer dans un package.

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Heure de publication : 09 août 2022